Chromosom 6p22 Locus związany z klinicznie agresywnym nerwiakiem płodowym ad

Próbki krwi od pacjentów z nerwiakiem zarodkowym zidentyfikowano poprzez biorepository neuroblastoma z Children s Oncology Group w celu pobrania próbki w momencie diagnozy. Większość próbek została opatrzona informacją kliniczną i genomową, która obejmowała wiek pacjenta w chwili rozpoznania, miejsce pochodzenia nowotworu, stopień zaawansowania choroby według międzynarodowego systemu klasyfikacji nerwiaka zarodkowego, 15 klasyfikację patologii międzynarodowego nerwiaka niedojrzałego, 16 kopii kodu onkogenu MYCN, 17 wskaźników DNA ( tj. status ploidii), 18 rejestracji w badaniu klinicznym lub badaniach klinicznych, wolne od zdarzeń i całkowite przeżycie, drugie guzy i wszelkie związane z nimi stany (np. wrodzone nieprawidłowości). Kryterium kwalifikowalności do genotypowania genomewidów było dostępność 1,5 .g DNA o wysokiej jakości ze źródła wolnego od nowotworu, takiego jak komórki jednojądrzaste krwi obwodowej lub jednojądrzaste szpiku kostnego, które nie były uwarunkowane nowotworem. Continue reading „Chromosom 6p22 Locus związany z klinicznie agresywnym nerwiakiem płodowym ad”

Chromosom 6p22 Locus związany z klinicznie agresywnym nerwiakiem płodowym

Neuroblastoma to złośliwy stan rozwijającego się współczulnego układu nerwowego, który najczęściej dotyka małe dzieci i często jest śmiertelny. Jego przyczyna nie jest znana. Metody
Przeprowadziliśmy badanie asocjacyjne genomewidu przez pierwsze genotypowanie próbek DNA krwi od 1032 pacjentów z nerwiakiem niedojrzałym i 2043 zwierząt z grupy kontrolnej pochodzenia europejskiego przy użyciu urządzenia Illumina HumanHap550 BeadChip. Próbki z trzech niezależnych grup pacjentów z nerwiakiem zarodkowym (w sumie 720 pacjentów) i 2128 osobników kontrolnych genotypowano następnie w celu replikacji znaczących asocjacji.
Wyniki
Zaobserwowaliśmy znaczący związek między nerwiakiem zarodkowym a zwykłymi mniejszymi allelami trzech kolejnych polimorfizmów pojedynczego nukleotydu (SNP) w paśmie chromosomowym 6p22 i zawierającym przewidywane geny FLJ22536 i FLJ44180 (P = 1,71 x 10-9 do 7,01 x 10-10; alleliczne; iloraz szans 1,39 do 1,40). Continue reading „Chromosom 6p22 Locus związany z klinicznie agresywnym nerwiakiem płodowym”

Pęknięcie zwapnionego ścięgna Achillesa

69-letni mężczyzna pokazał w izbie przyjęć przeszywający ból i obrzęk prawej nogi podczas wstawania z pozycji siedzącej. Podczas badania klinicznego podejrzewano pęknięcie ścięgna Achillesa. Zwykłe radiogramy wykazały całkowite rozerwanie zwapniałego ścięgna Achillesa (panele A i B, strzałki), co zostało potwierdzone przez ultrasonografię. Pacjent poinformował, że gdy miał 13 lat, jego ścięgno Achillesa zostało częściowo pocięte przez spadający tasak. Podróżował z odległej wioski do szpitala powiatowego publicznym autobusem, gdzie jego ścięgno Achillesa i skóra zostały zszyte w izbie przyjęć, podczas gdy on miał tylko miejscowe znieczulenie. Continue reading „Pęknięcie zwapnionego ścięgna Achillesa”

Rozszerzenie terapii adiuwantowej Aromatase-Inhibitor na 10 lat ad 5

Krzywe Kaplana-Meiera dla przeżycia wolnego od choroby przedstawiono na rycinie 1A. Częstość 5-letniego przeżycia wolnego od choroby wynosiła 95% (95% przedział ufności [CI], 93 do 96) w grupie letrozolu i 91% (95% CI, 89 do 93) w grupie placebo. Współczynnik ryzyka z nawrotem choroby lub występowaniem kontralateralnego raka piersi z letrozolem w porównaniu do placebo wynosił 0,66 (95% CI, 0,48 do 0,91, P = 0,01). Wcześniej określona analiza wrażliwości okresu przeżycia wolnego od choroby obejmującego wszystkie zgony z powodu raka piersi jako zdarzenia dała takie same wyniki jak analiza pierwotna, ponieważ wszyscy pacjenci, którzy zmarli na raka piersi, również mieli nawroty przed lub w momencie ich śmierci. Analiza wrażliwości na post hoc przeżycia wolnego od choroby, która obejmowała wszystkie zgony jako zdarzenia, wykazała odsetek 5-letniego przeżycia bez choroby wynoszącego 90% (95% CI, 88 do 92) z letrozolem w porównaniu do 88% (95% CI, 86 do 90) z placebo. Continue reading „Rozszerzenie terapii adiuwantowej Aromatase-Inhibitor na 10 lat ad 5”

Wpływ intensywnego obniżania poziomu glukozy w cukrzycy typu 2 ad

Hipotezę tę potwierdziły wyniki niektórych, ale nie wszystkich wcześniejszych badań klinicznych.1 Hipoteza ta nie została jednak jednoznacznie przetestowana w odpowiednio zasilanych, randomizowanych badaniach klinicznych dotyczących wyników sercowo-naczyniowych. Niemniej jednak, dane z podstawowej wiedzy naukowej, analizy epidemiologicznej i ograniczonych badań zostały wykorzystane do poparcia zalecanych wytycznych w celu osiągnięcia zbliżonych do prawidłowych poziomów glikowanej hemoglobiny i glukozy u wybranych pacjentów z cukrzycą typu 2, 5-8, pomimo niewielkiej ilości dowodów dotyczących ryzyko i korzyści związane z obecnie dostępnymi terapiami. Działanie kontrolujące ryzyko sercowo-naczyniowe u chorych na cukrzycę (ACCORD) zostało opracowane specjalnie w celu ustalenia, czy strategia terapeutyczna ukierunkowana na normalne stężenie hemoglobiny glikowanej (tj. Poniżej 6,0%) zmniejszyłaby częstość incydentów sercowo-naczyniowych, w porównaniu ze strategią ukierunkowaną na stężenie hemoglobiny glikowanej od 7,0 do 7,9% u osób w średnim i starszym wieku z cukrzycą typu 2 i ustaloną chorobą sercowo-naczyniową lub dodatkowymi czynnikami ryzyka sercowo-naczyniowego. Stwierdzenie wyższej śmiertelności w grupie intensywnej terapii doprowadziło do decyzji o zakończeniu intensywnego leczenia w lutym 2008 r., 17 miesięcy przed planowanym zakończeniem badania. Continue reading „Wpływ intensywnego obniżania poziomu glukozy w cukrzycy typu 2 ad”

Wpływ intensywnego obniżania poziomu glukozy w cukrzycy typu 2

Badania epidemiologiczne wykazały związek między poziomem hemoglobiny glikowanej a zdarzeniami sercowo-naczyniowymi u pacjentów z cukrzycą typu 2. Zbadaliśmy, czy intensywna terapia zmierzająca do osiągnięcia normalnego poziomu hemoglobiny glikowanej zmniejszyłaby liczbę zdarzeń sercowo-naczyniowych u pacjentów z cukrzycą typu 2, którzy albo stwierdzili chorobę sercowo-naczyniową, albo dodatkowe czynniki ryzyka sercowo-naczyniowego. Metody
W tym randomizowanym badaniu 10 251 pacjentów (średni wiek 62,2 lat) z medianą poziomu glikowanej hemoglobiny 8,1% przydzielono do intensywnej terapii (ukierunkowanej na poziom hemoglobiny glikowanej poniżej 6,0%) lub terapii standardowej (ukierunkowanej na poziom od 7,0 do 7,9). %). Spośród tych pacjentów 38% stanowiły kobiety, a 35% miało wcześniejsze zdarzenie sercowo-naczyniowe. Continue reading „Wpływ intensywnego obniżania poziomu glukozy w cukrzycy typu 2”

Chromosom 6p22 Locus związany z klinicznie agresywnym nerwiakiem płodowym ad 6

Wszystkie trzy SNP były związane z bardziej złośliwą prezentacją kliniczną i agresywnym przebiegiem choroby (Ryc. 3). W związku z tym nowotwory, które miały przerzuty w diagnozie były bardziej prawdopodobne u pacjentów z nerwiakiem zarodkowym, którzy byli homozygotyczni pod względem zagrożonych alleli (p = 0,006, p = 0,008, a p = 0,024 odpowiednio dla rs4712653, rs9295536 i rs6939340), mieć nabytą somatycznie amplifikację onkogenu MYCN w komórkach nowotworowych (P = 0,002, P = 0,003, i P = 0,006, odpowiednio), i mieć klasyfikację wysokiego ryzyka dla celów stratyfikacji leczenia (P = 0,002, P = 0,001, i odpowiednio P = 0,011), w porównaniu z pacjentami z nerwiakiem zarodkowym, którzy byli homozygotyczni pod względem alleli niezwiązanych z ryzykiem (Tabela S4 i Ponadto pacjenci, którzy byli homozygotyczni pod względem alleli ryzyka mieli znacząco zmniejszone prawdopodobieństwo przeżycia wolnego od zdarzeń (p = 0,016 dla SNP rs6939340) (ryc. S2 w dodatkowym dodatku). To skojarzenie z bardziej złośliwą chorobą może wyjaśnić, dlaczego byliśmy w stanie wykazać replikację wyników we względnie małej serii 59 pacjentów z grupy dzieci chorych na raka, którzy składali się wyłącznie z pacjentów wysokiego ryzyka (Tabela 2). Continue reading „Chromosom 6p22 Locus związany z klinicznie agresywnym nerwiakiem płodowym ad 6”

Chromosom 6p22 Locus związany z klinicznie agresywnym nerwiakiem płodowym ad 5

Skrócone statystyki Eigenstrat dla pełnego zestawu danych są dostępne w repozytorium bazy danych National Institutes of Health Genotype and Phenotype (dbGAP; www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi . study_id = phs000124.v1.p1) (numer dostępu, phs000124.v1.p1). Trzy najwyższe SNP wykazujące znaczący związek z nerwiakiem niedojrzałym były w ścisłym powiązaniu z nierównowagą chromosomu 6p22 (rs6939340, rs4712653 i rs9295536), dając wartości P 1,71 x 10-9 do 7,01 x 10-10 (allelowy iloraz szans 1,39 do 1,40) (Rysunek i Tabela oraz Tabela S2 w dodatkowym dodatku). Dwa dodatkowe SNP na chromosomie 20p11 (rs3790171 i rs7272481) wykazały istotne dla pojedynczego markera wartości P dla genomewidu, a wiele innych było bardzo zbliżonych do progu istotności dla progów genowych (figura 1). Jednak tylko wyniki badania asocjacji chromosomu 6 zachowały znaczenie dla całego genomu po dalszej korekcie dla podstruktury populacyjnej przy użyciu analiz głównych składowych zaimplementowanych w Eigenstrat 22, 23 (Tabela 1). Continue reading „Chromosom 6p22 Locus związany z klinicznie agresywnym nerwiakiem płodowym ad 5”

Chromosom 6p22 Locus związany z klinicznie agresywnym nerwiakiem płodowym czesc 4

Allelic odds ratio i odpowiadające im 95% przedziały ufności zostały obliczone dla analiz asocjacyjnych. Dodatkowo, w celu dalszej kontroli potencjalnego zakłócającego wpływu stratyfikacji populacji, przeprowadziliśmy analizy asocjacyjne po korekcie dla podstruktury opartej na analizie głównych składników zaimplementowanej w Eigenstrat.22,23 Dla każdego SNP używaliśmy domyślnych ustawień w programie i wykonaliśmy zmodyfikowany test trendu Cochran-Armitage, dostosowując go do pięciu głównych komponentów, 22, 23 i raportujemy wynik jako wartość E wartości. Rysunek S1 w dodatkowym dodatku pokazuje wykresy kwantowania kwantylowego przed i po korekcie. Spośród 1032 pacjentów włączonych do serii przypadków fazy odkrywania, dane kliniczne i biologiczne współzmienne uzyskiwane podczas diagnozy były dostępne dla większości osób (Tabela Pełne dane dotyczące wyników były dostępne dla 883 pacjentów (85,6%), z medianą czasu obserwacji wynoszącą 4,02 roku dla pacjentów bez zdarzeń. Analizy asocjacyjne SNP chromosomu 6p22 o charakterystyce klinicznej wykonano za pomocą testu chi-kwadrat na allelu i liczebności genotypu. Continue reading „Chromosom 6p22 Locus związany z klinicznie agresywnym nerwiakiem płodowym czesc 4”

Wpływ intensywnego obniżania poziomu glukozy w cukrzycy typu 2 ad 7

Wskaźniki zagrożenia dla pierwotnego wyniku i zgonu z jakiejkolwiek przyczyny w wcześniej określonych podgrupach. Dane dotyczące stężenia hemoglobiny glikowanej w punkcie wyjściowym przedstawiono dla 10 288 pacjentów, ponieważ poziom podstawowy nie był dostępny dla 23 pacjentów. Poziome kreski reprezentują przedział ufności 95%, a pionowe linie przerywane wskazują ogólny współczynnik ryzyka. Wielkość każdego kwadratu jest proporcjonalna do liczby pacjentów.
Częstość zgonów z jakiejkolwiek przyczyny była wyższa w grupie intensywnej terapii niż w grupie standardowej (5,0% w porównaniu z 4,0%, współczynnik ryzyka, 1,22, 95% CI, 1,01 do 1,46, P = 0,04). Continue reading „Wpływ intensywnego obniżania poziomu glukozy w cukrzycy typu 2 ad 7”