Przekazywanie gruźlicy o dużej oporności na leki w Afryce Południowej ad 5

Wśród zapisanych uczestników 234 stanowiły kobiety (58%), średni wiek wynosił 34 lata (zakres międzykwartylowy, 28 do 43), a 50% żyło na obszarach wiejskich (tabela 1). W sumie 311 uczestników (77%) miało zakażenie wirusem HIV, z czego 236 (76%) otrzymywało leczenie przeciwretrowirusowe. Mediana liczby CD4 + wynosiła 340 komórek na milimetr sześcienny (odległość międzykwartylowa, 117 do 431), a 155 uczestników (50%) miało niewykrywalne obciążenie wirusem. Rozmaz plwociny w przypadku prątków kwasoopornych był pozytywny u 270 uczestników (67%), a 70 uczestników (17%) miało chorobę kawitacyjną. Czterdziestu czterech uczestników (11%) zmarło przed włączeniem do badania, a członek rodziny wyraził zgodę na rejestrację. Nabyte a przeniesione opory
W sumie 124 uczestników (31%) było uprzednio leczonych z powodu gruźlicy MDR, a podejrzewano, że gruźlica XDR rozwinęła się poprzez nabytą oporność, zgodnie z definicją przypadku klinicznego (ryc. S2 w dodatku uzupełniającym). Wyniki leczenia z poprzedniego epizodu gruźlicy MDR były leczeniem lub zakończonym leczeniem u 6% uczestników, niepowodzeniem leczenia w 84% i utratą w obserwacji lub transferze w 10% (Tabela 1). Żaden z uczestników nie otrzymał fluorochinolonu lub antybiotyków do wstrzykiwań przez 10 dni lub dłużej w przypadku innych wskazań niż gruźlica. Gruźlica XDR rozwinęła się u pozostałych 280 uczestników (69%) poprzez przeniesienie szczepu gruźlicy XDR.
Figura 2. Figura 2. Drzewo filogenetyczne o maksymalnym prawdopodobieństwie opartym na nukleotydach (SNP). Izolaty są znakowane zgodnie z numerem identyfikacyjnym badania i kodowane kolorem zgodnie z grupą polimorfizmu o długości fragmentów restrykcyjnych (RFLP). Grupy pojedynczego izolatu RFLP są przedstawione kolorem czarnym. Drzewo jest zakorzenione do izolatu linii 7 Percy256. L2 oznacza linię 2 i linię L4 4. Inne skróty (MH, W, AH, BW, BH, GY, CC i HP) oznaczają wspólne schematy RFLP widziane między izolatami. Litery zostały przypisane po raz pierwszy, gdy zaobserwowano określony wzór RFLP (często wiele lat przed bieżącym badaniem). Niebieskie okrągłe pasmo pokazuje, że wszystkie izolaty na gałęziach na drzewie poniżej są z linii 4. Pomarańczowy pasek pokazuje, że izolaty pod nim należą do linii 2. W środku okrągłego drzewa, jedna duża gałąź oddziela wszystkie izoluje poniżej pomarańczowego pasma od tych poniżej niebieskiej taśmy. Wszystkie wewnętrzne węzły oddzielające grupy RFLP są obsługiwane przez 100 ze 100 replikacji bootstrap. Publicznie dostępne sekwencje (które nie są sekwencjonowane w tym badaniu) są oznaczone gwiazdkami. Pasek skali wskazuje oszacowaną maksymalną wiarygodność liczby substytucji na witrynę.
IS6110 RFLP i sekwencjonowane sekwencjonowanie genów zostały zakończone w izolatach M. tuberculosis uzyskanych od 386 uczestników (96%). Spośród tych izolatów 323 (84%) miało genotyp, który odpowiadał genotypowi izolatu od innego uczestnika badania (ryc. S2 w dodatku uzupełniającym). Pasujące izolaty utworzyły 31 skupisk o rozmiarach od 2 do 14 uczestników, z wyjątkiem jednego dużego skupiska 212 uczestników (55%) ze szczepem LAM4 / KZN (tabela S1 w dodatkowym dodatku). W obrębie klastrów mediana różnicy SNP w parach wynosiła 5 SNP dla najbliższego uczestnika (obszar międzykwartylny, 3 do 8) i 16 SNP spośród wszystkich elementów klastra; sekwencjonowanie całego genomu nie może dalej dzielić gromady LAM4 / KZN na podgrupy (rysunek 2).
Zgodnie z połączonymi definicjami przypadków klinicznych i genotypowych, 61% uczestników nie otrzymało wcześniej leczenia gruźlicy MDR, a ich izolaty były częścią klastra genotypowego; ten odsetek stanowi minimalny szacunek proporcji uczestników z gruźlicą XDR, które rozwinęły się w wyniku transmisji (ryc
[hasła pokrewne: ardi bartoszyce, gedia nowa sól, grypa zoladkowa objawy ]

Powiązane tematy z artykułem: ardi bartoszyce gedia nowa sól grypa zoladkowa objawy