Przekazywanie gruźlicy o dużej oporności na leki w Afryce Południowej cd

Uczestnicy zostali poproszeni o wyliczenie lokalizacji społeczności, w których spędzili 2 lub więcej godzin tygodniowo i kontaktów w tych witrynach. Została uzyskana współrzędna systemu globalnego pozycjonowania dla domu każdego uczestnika i została wykreślona za pomocą oprogramowania ArcGIS. Uczestnikom o nieznanym statusie HIV zaoferowano testowanie na obecność wirusa HIV i zwrócono się o pomoc, jeśli wyniki były pozytywne dla wirusa HIV. Liczbę komórek CD4 + i miano wirusa badano u osób z zakażeniem HIV. Dokumentację medyczną uzyskano z placówki diagnostycznej i specjalistycznych szpitali gruźlicy, w których uczestnik został przyjęty. Zapisy zostały sprawdzone pod kątem wcześniejszego leczenia wszelkimi lekami przeciwgruźliczymi – w tym w przypadku wskazań innych niż gruźlica – oraz wcześniejszymi wynikami testów wrażliwości na leki.
Badanie zostało zaaprobowane przez komisje przeglądowe uniwersytetu Emory, College of Medicine Alberta Einsteina i University of KwaZulu-Natal oraz przez Centers for Disease Control and Prevention.
Metody laboratoryjne
Od wszystkich uczestników uzyskano diagnostyczny izolat gruźlicy XDR. Izolaty przeszły sekwencję genotypową insercji (IS) 6110 polimorfizmu długości polimorfizmu długości restrykcyjnej (RFLP) i ukierunkowane sekwencjonowanie ośmiu regionów nadających oporność na rifampinę, izoniazyd, pirazynamid, fluorochinolony i leki iniekcyjne drugiej linii. Te regiony były rpoB, katG, inhA, pncA, gyrA, rpsL, rrs i gidB.17. Część 298 izolatów poddano sekwencjonowaniu całego genomu parzystego. (Szczegóły znajdują się w sekcji Metody w dodatkowym dodatku, dostępnym wraz z pełnym tekstem tego artykułu na stronie.)
Nabyte a przeniesione opory
Zastosowaliśmy definicję przypadku klinicznego, aby ustalić, czy wśród uczestników zespołu rozwinęła się gruźlica XDR z powodu nabytej oporności lub transmisji. Uczestnicy, którzy spełnili którekolwiek z poniższych kryteriów, uznawali gruźlicę XDR, która rozwinęła się w wyniku nabytej oporności: samoopisanie leczenia gruźlicy MDR 30 lub więcej dni przed rozpoznaniem gruźlicy XDR, dokumentacja medyczna leczenia gruźlicy MDR przed rozpoznaniem gruźlicy XDR, dokumentacja medyczna dokumentująca 10 lub więcej dni leczenia lekami przeciwprątkowymi drugiego rzutu w celu wskazania innego niż gruźlica lub jakiekolwiek wcześniejsze wyniki badań lekowrażliwości wykazujących oporność na izoniazyd i ryfampinę, ale podatność na fluorochinolony lub wstrzykiwanie drugiego rzutu narkotyków (np. gruźlica MDR lub gruźlica pre-XDR). Uczestnicy, którzy nie spełniali któregokolwiek z tych kryteriów, zostali zakwalifikowani jako posiadający gruźlicę XDR, która rozwinęła się z powodu przeniesionego oporu.
Opracowaliśmy także definicję genotypowego przypadku, aby odróżnić nabytą odporność od przenoszonej oporności. Izolaty Mycobacterium tuberculosis ze wzorami RFLP w obrębie 1-pasmowej różnicy i identyczne ukierunkowane sekwencjonowanie genów dla inhA, katG, rpoB, pncA i gyrA zostały uznane za tworzące klastry genotypowe i będące wynikiem transmisji. Niezrównane izolaty były uważane za wyjątkowe i wynikały z nabytej oporności. Do potwierdzenia definicji genotypu użyto parowania polimorfizmu pojedynczych nukleotydów (SNP) z sekwencjonowania całego genomu (ryc.
[patrz też: perwersyjna siostra filmweb, nosolan, nifco żory ]

Powiązane tematy z artykułem: nifco żory nosolan perwersyjna siostra filmweb